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Salut,J'utilise aussi Thunderbird depuis des années et j'ai (entre autres) un compte gmail (Android oblige) et je n'ai jamais eu aucun souci.
Précision : je suis avec la version 52.9.1 de Thunderbird sous LinuxMint18.3, LM19 & Manjaro avec mes comptes-mail partagés entre les différentes distros (et ça marche avec les 3 distributions avec exactement les même paramètres vu qu'ils sont partagés).
Donc pour Gmail, es-tu sûr que tu utilises du IMAP (et pas du Pop) : dans les paramètres du serveur vérifie (chez moi c'est le port 993 qui est ouvert).
Capture faite sous LinuxMint19 XFCE :

Il me semble aussi, si je me rappelle bien, que dans Gmail sur navigateur-web, il faut dire que tu fais confiance à l'application-tierce qui veut l'utiliser (dans notre cas Thunderbird)