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[résolu] Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 13:12
par S00uuriiree
Bonjour à tous, étant nouveau dans l'univers de Linux je viens vous demander votre aide afin de résoudre un petit problème que je rencontre actuellement.

Bon, avant tout je tiens à vous préciser que je suis actuellement sous Linux Mint 18.1 Serena (Noyau linux 4.9.6) et j'ai besoin, dans le cadre de mon travail, d'utiliser des logiciels programmés sous Debian (Jessie). Le programmeur qui s'occupe de la programmation des logiciels en question m'a parlé de pleins de choses (incompatibilité, stretch...) que je n'ai pas vraiment compris. J'aimerai savoir s'il est vraiment impossible de faire tourner ses logiciels sous ma version de Mint.

Voici ce que mon terminal m'indique lorsque j'essaie de faire un apt-get update
Image

En vous remerciant par avance pour votre aide,

Cordialement,

FF

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 13:18
par débitant
bonjour,
plutôt qu'un screen, fait un copier de ton terminal et un coller entre les balises "code", ce sera plus lisible ;)

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 13:32
par patrice63261
Bonjour,
J'arrive a lire ppaso.inra.fr dans ta copie ecran
Il semblerait qu'en plus des depots officiels ton ordi veut interroger un autre depot ppa
C'est ce ppa qui mets le bazar, car ton linux n'arrive pas a l'interroger.
En regardant bien, il y a pas mal de ppa installé sur cet ordi

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 13:39
par mpat
salut,

normal tu es sous L18 source Ubuntu et tu veux mettre à jour via debian/stretch.

si tu veux du debian, il te faut installer Lmde2 qui est de source debian.

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 13:42
par S00uuriiree
Bonjour, je te remercie pour ta réponse. Je mettrais des copies textes de mon terminal la prochaine fois ! Merci pour l'info :)
Vis-à-vis du ppa PAPPSO, c'est normal. Il s'agit du dépôt du laboratoire (INRA) qui a créer les logiciels que je souhaite installer. J'ai pleinement confiance en eux. Les autres ppa, je pense pouvoir les supprimer. Le seul que j'ai installer (hormis celui de PAPPSO) c'est le ppa teejee que j'ai installé pour pouvoir changer de kernel. Vu que je ne parvenais pas à installer les logiciels PAPPSO, je m'étais dit qu'en installant un kernel plus ancien cela pourrait marcher... Je vais le désinstaller vu que ça ne fonctionne pas mieux ^^
Ce que je constate, c'est que mon ordinateur ne parvient pas à se connecter au dépot de l'INRA. Lorsque je suis les instructions données sur le site PAPPSO pour installer leurs logiciels, mon système ne reconnait pas les commandes. Ci-après, les instructions données par le site :

Repository installation for Debian 8 Jessie
Our packages are available for Debian Jessie from this repository :
http://pappso.inra.fr/debian" onclick="window.open(this.href);return false;
Sources list modification
To add this repository to your Ubuntu or Debian system, create as root this file :
/etc/apt/sources.list.d/pappso.list
and add the following content :
deb http://pappso.inra.fr/debian" onclick="window.open(this.href);return false; jessie main contrib non-free
deb-src http://pappso.inra.fr/debian" onclick="window.open(this.href);return false; jessie main contrib non-free
Secure apt
The PAPPSO Debian repository is signed with the key of "Olivier Langella <Olivier.Langella@moulon.inra.fr>" with key ID 9C6909E7. You can fetch and import this with (as root):
wget -O - http://pappso.inra.fr/apt/conf/pappso_langella.gpg.key" onclick="window.open(this.href);return false; | apt-key add -
Install packages
Update your system (as root):
apt-get update
Done. You are ready to install any proteomic software from our repository with (for example):
sudo apt-get install xtandempipeline masschroq-studio

Elles ne fonctionnent pas ou alors j'ai un message m'indiquant que l'accès à a liste de sources est refusé (alors que je suis en root).

Je sais plus quoi faire...

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 13:46
par S00uuriiree
mpat a écrit :salut,

normal tu es sous L18 source Ubuntu et tu veux mettre à jour via debian/stretch.

si tu veux du debian, il te faut installer Lmde2 qui est de source debian.
Bonjour et merci pour ta réponse. Oui, ma version de Mint est basée sur Ubuntu mais c'est également le cas de celle de mon directeur de thèse qui, lui, peut utiliser les logiciels en question. Je lui ai demandé comment il avait fait pour les installer mais il ne s'en rappelle plus ^^ Cela fait un bon bout de temps qu'il les utilise... Je dois donc me débrouiller avec mes faibles connaissances sur Linux (et en informatique de manière générale). C'est pour cela que j'avais envisagé d'installer un kernel plus ancien, sauf que visiblement, cela ne marche pas... De plus, dans les instructions d'installation données par L'INRA, il est bien indiqué qu'on peut installer ces logiciels sur un système UBUNTU...

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 14:04
par mpat
re ton truc ça marche, je te fais un tuto pour l'installation prend un peu patience.


Image

en premier il faut installer openjdk-7-jre

Code : Tout sélectionner

sudo add-apt-repository ppa:openjdk-r/ppa  

Code : Tout sélectionner

sudo apt-get update 

Code : Tout sélectionner

sudo apt-get install openjdk-7-jdk
ensuite avec ton éditeur de texte il faut créer le fichier pappso.list

Code : Tout sélectionner

sudo xed /etc/apt/sources.list.d/pappso.list
dans ce fichier que tu vas créer tu colles ceci dedans.

Code : Tout sélectionner

deb http://pappso.inra.fr/debian wheezy main contrib non-free
deb-src http://pappso.inra.fr/debian wheezy main contrib non-free

deb http://pappso.inra.fr/debian wheezy-backports main contrib non-free
deb-src http://pappso.inra.fr/debian wheezy-backports main contrib non-free
tu ouvres un terminal et tu te places en root
su + pass
et tu colle ceci dans ton terminal.

Code : Tout sélectionner

wget -O - http://pappso.inra.fr/apt/conf/pappso_langella.gpg.key | apt-key add -

Code : Tout sélectionner

apt-get update

Code : Tout sélectionner

sudo apt-get install xtandempipeline masschroq-studio 


l'installation finie tu vas dans tes menus et tu trouves ceci


Image

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 14:12
par S00uuriiree
mpat a écrit :re ton truc ça marche, je te fais un tuto pour l'installation prend un peu patience.


Image

Oh purée merci beaucoup beaucoup ! Je ne sais pas comment vous avez fait, mais si j'arrive à suivre votre tutoriel sans faire de boulette, vous m'aurez rendu un immense service...

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 14:16
par mpat
relis le poste plus haut j'ai mis le tuto a+

le ppa opendjk tu peux le supprimer après l'installation

Re: Impossible d'installer certains programmes

Posté : dim. 29 janv. 2017 14:39
par thyam
trrrooopppp fort mpat ;)