Trouvé ! Le fichier des marque-pages de Nemo (et je suppose les autres explorateurs de fichiers) se trouve dans ~/.config/gtk-3.0/bookmarks. Il suffit de l'effacer et de remplir à la main les marque-pages...
LinuxMint Virginia Cinnamon et d'autres machines en MATE, XFCE... 20.x , 21.x ou 19.x
Tour : Asus F2A55 / AMD A8-5600K APU 3,6GHz / RAM 17Go / SSD 4To /Nvidia GeForce GT610 / LM21.3 Cinnamon
Portable : LDLC Mercure MH :Intel® Pentium(R) Silver N5030 CPU @ 1.10GHz × 4/RAM 8Go / Intel HD graphics 500 i915 / ) - LM22.1 MATE (sur HDD)